小智（松本梨花 配音）带着皮卡丘（大谷育江 配音），和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上，一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴（钉宫理惠 配音）的少女麦亚丽（中川翔子 配音）。胡巴能够制造出神奇的时空圆环，带领大家在不同的地点来回穿梭。 地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。
栗田贯一 小林清志 井上真树夫 增山江威子 纳谷悟朗 平野绫 朴璐美 津嘉山正种 玄田哲章 藤原启治 永田博丈 后藤哲夫 三上哲 莲池龙三 山田敦彦 皆木俊彦 贵志昌文 雨宫弘树 伊牟田大 坂井恭子
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矢岛晶子 楢桥美纪 藤原启治 高田由美 真柴摩利 林玉绪 佐藤智惠 铃木玲子 富田耕生 中田浩二 加藤精三 纳谷六朗 屋良有作 盐泽兼人 笹冈繁藏 坂东尚树 山崎巧 挂川裕彦 优希比吕 宫内幸平 纱由里 兴梠里美 川田妙子 小宫悦子
高山南 山崎和佳奈 神谷明 松井菜樱子 山口胜平 桑岛法子 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 绪方贤一 茶风林 井上和彦 汤屋敦子 千叶一伸 目黑光祐 水谷优子 金月真美 古泽彻 百百麻子 山里亮太 坂下千里子 西尾由佳理 田中信夫 依田英助